Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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AtrxQ61687 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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AtrxQ61687 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrxQ61687 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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AtrxQ61687 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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AtrxQ61687 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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AtrxQ61687 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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AtrxQ61687 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrxQ61687 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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