Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms