Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms