Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms