Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms