Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Traf3Q60803 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Traf3Q60803 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Traf3Q60803 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Traf3Q60803 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Traf3Q60803 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Traf3Q60803 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Traf3Q60803 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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