Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms