Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms