Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim38Q5SZ99 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim38Q5SZ99 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim38Q5SZ99 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Trim38Q5SZ99 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trim38Q5SZ99 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim38Q5SZ99 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim38Q5SZ99 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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