Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms