Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bod1Q5SQY2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms