Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms