Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Urb1Q571H0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Urb1Q571H0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Urb1Q571H0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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