Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eme2Q56A04 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eme2Q56A04 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eme2Q56A04 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eme2Q56A04 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eme2Q56A04 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eme2Q56A04 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eme2Q56A04 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eme2Q56A04 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eme2Q56A04 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eme2Q56A04 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eme2Q56A04 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms