Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Snx33Q4VAA7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Snx33Q4VAA7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Snx33Q4VAA7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Snx33Q4VAA7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Snx33Q4VAA7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx33Q4VAA7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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