Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms