Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms