Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Syne3Q4FZC9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Syne3Q4FZC9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Syne3Q4FZC9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Syne3Q4FZC9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Syne3Q4FZC9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Syne3Q4FZC9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Syne3Q4FZC9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Syne3Q4FZC9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Syne3Q4FZC9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms