Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms