Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms