Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
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Lrrc43Q3V0L5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Lrrc43Q3V0L5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Lrrc43Q3V0L5 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Lrrc43Q3V0L5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Lrrc43Q3V0L5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Lrrc43Q3V0L5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Lrrc43Q3V0L5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Lrrc43Q3V0L5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Lrrc43Q3V0L5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Lrrc43Q3V0L5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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