Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnpc3Q3UZ01 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms