Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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