Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms