Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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