Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms