Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxosQ3UL53 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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