Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Usp19Q3UJD6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Usp19Q3UJD6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
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Usp19Q3UJD6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Usp19Q3UJD6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Usp19Q3UJD6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Usp19Q3UJD6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Usp19Q3UJD6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Usp19Q3UJD6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Usp19Q3UJD6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Usp19Q3UJD6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms