Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms