Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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