Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms