Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms