Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms