Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rnf40Q3U319 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rnf40Q3U319 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf40Q3U319 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf40Q3U319 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rnf40Q3U319 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rnf40Q3U319 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rnf40Q3U319 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf40Q3U319 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rnf40Q3U319 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf40Q3U319 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf40Q3U319 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rnf40Q3U319 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rnf40Q3U319 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rnf40Q3U319 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf40Q3U319 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rnf40Q3U319 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rnf40Q3U319 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf40Q3U319 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rnf40Q3U319 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf40Q3U319 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rnf40Q3U319 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf40Q3U319 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf40Q3U319 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf40Q3U319 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf40Q3U319 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf40Q3U319 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf40Q3U319 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf40Q3U319 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf40Q3U319 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rnf40Q3U319 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf40Q3U319 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf40Q3U319 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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