Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms