Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf149Q3U2C5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms