Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms