Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms