Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms