Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccndbp1Q3TVC7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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