Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms