Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trappc13Q3TIR1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trappc13Q3TIR1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trappc13Q3TIR1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trappc13Q3TIR1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trappc13Q3TIR1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trappc13Q3TIR1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trappc13Q3TIR1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trappc13Q3TIR1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trappc13Q3TIR1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Trappc13Q3TIR1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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