Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Fam171bQ14CH0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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