Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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