Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Rpusd3Q14AI6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Rpusd3Q14AI6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Rpusd3Q14AI6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Rpusd3Q14AI6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Rpusd3Q14AI6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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