Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms