Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms