Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms