Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms