Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms